انتخاب ژنومی
Authors
abstract
در دهه های اخیر همزمان با پیشرفت ژنتیک ملکولی تحقیقات زیادی برای شناسایی ژنها و یا قطعات کروموزومی موثر بر صفات مهم اقتصادی در حیوانات اهلی انجام شده است. علیرغم پژوهش های متعددی که در ارتباط با انتخاب به کمک نشانگر (mas) انجام شد، به دلیل محدودیت های این روش کاربرد های آن محدود و افزایش پیشرفت ژنتیکی کم بوده است. با تکمیل موفقیت آمیز توالی یابی ژنوم انسان و پیشرفت های عظیم در تکنولوژی ژنوتیپ کردن چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (snp) سطح ژنوم با هزینه کم و سرعت و دقت بالا، این امکان فراهم شده است که بتوان انتخاب بر پایه نشانگر را در یک مقیاس ژنومی استفاده نمود که به این روش، اصطلاحا انتخاب ژنومی گفته می شود. انتخاب ژنومی با استفاده از نقشه های نشانگری با تراکم زیاد، بخصوص snpهایی که کل ژنوم را شامل می شوند و اغلب در عدم تعادل پیوستگی با qtl های مجاور خود هستند، ارزش ژنتیکی کل را پیش بینی می کند. محاسبه ارزشهای اصلاحی ژنومی نیازمند برآورد اثرات نشانگرها در شماری از حیوانات یک جمعیت بوده که هم دارای اطلاعات فنوتیپی و هم دارای ژنوتیپ نشانگرها هستند و به آنها جمعیت مرجع گفته می شود. سپس اثرات برآوردی نشانگرها در جمعیت مرجع برای محاسبه ارزش اصلاحی ژنومی حیوانات کاندید انتخاب در جمعیت تایید که فقط دارای اطلاعات نشانگری هستند، استفاده می شوند. بر اساس مطالعات انجام شده عوامل موثر بر صحت ارزیابی های ژنومی توارث پذیری صفت، اندازه جمعیت مرجع، درجه خویشاوندی کاندیداهای انتخاب با جمعیت مرجع، عدم تعادل بین نشانگرها و qtl ها، روش مورد استفاده در برآورد اثرات نشانگرها و توزیع اثرات qtl ها هستند. به طور خلاصه از مزایای انتخاب ژنومی نسبت به انتخاب سنتی می توان به کاهش فاصله نسل و افزایش صحت ارزیابی ها اشاره کرد که علاوه بر کاهش هزینه ها سبب افزایش پیشرفت ژنتیکی می شوند. از طرفی روش انتخاب ژنومی از نشانگرها برای برآورد دقیق واریانس نمونه گیری مندلی استفاده کرده و از این طریق باعث کاهش نرخ همخونی نسبت به روشهای سنتی انتخاب می شود.
similar resources
برآورد صحت انتخاب ژنومی در جوامع کوچک ژنتیکی- مطالعه شبیهسازی
In the present study two genetically connected small and large populations were simulated and the effect of different sources of information from foreign populations on the accuracy of predicted genomic breeding values of young animals of the small population was investigated. A large population consist of 200000 animals over 15 generations and a small population consist of 5000 animals over 3 ...
full textکاوش ژنومی برای ردیابی نشانههای انتخاب در اسب نژاد ترکمن
Abstract Selection not only increases the frequency of new-useful mutations but also remains some signals throughout the genome. Since these areas are often control economically important traits, identifying and tracking these areas is the most important issue in the animal genetics. The aim of this study was to detecting signals of selection in the genome of Turkmen horse using 70K SNP chip...
full textمقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین
Genomic selection combines statistical methods with genomic data to predict genetic values for complex traits. The accuracy of prediction of genetic values in selected population has a great effect on the success of this selection method. Accuracy of genomic prediction is highly dependent on the statistical model used to estimate marker effects in reference population. Various factors such a...
full textپویش ژنومی نشانههای انتخاب در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی
شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بودهاند، از بحثبرانگیزترین مباحث در حوزة تحقیقات ژنتیک حیوانی، بهخصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند، اجرا شده است. بدین منظور 148 رأس گاومیش رودخانهای شامل جمعیتهای خوزستانی (121 رأس) و مازندرانی (27 رأس)، به وسیلة آرایههای ژن...
full textکارایی انتخاب ژنومی در برنامههای اصلاح نژاد مرغان بومی
The development of genomic selection has created new strategies in animal breeding programs. The aim of this study was to investigate the efficiency of genomic selection in breeding programs of native hens. In this study, a reference scenario with 3380 birds using pedigree and phenotypic information was simulated and the expected genetic progress was derived deterministically with the software ...
full textMy Resources
Save resource for easier access later
Journal title:
genetics in the 3rd millenniumجلد ۱۲، شماره ۴، صفحات ۳۷۹۴-۳۸۰۵
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023